De la transmisión en los dos modelos Boxster se ocupa ahora de serie una caja de cambios mecánica de 6 velocidades, ligera y óptimamente adaptada a la curva característica del motor. Los recorridos de cambio son deportivamente cortos, el esfuerzo de cambio mínimo. Esto se traduce en unos tiempos de cambio notablemente menores y, por tanto, una experiencia de conducción deportiva y directa. El cambio por mando de cable evita la transmisión de vibraciones procedentes del grupo propulsor a la palanca del cambio.