Los frenos Porsche son una medida a escala mundial de valores punta en cuanto a deceleración y estabilidad. En los nuevos modelos Boxster tampoco se trata sólo de prestaciones de propulsión, sino también de prestaciones de freno.

En los dos modelos se incorporan, tanto delante como detrás, frenos de mordazas fijas de aluminio de cuatro émbolos en arquitectura monobloque. Esta arquitectura se caracteriza por su elevada resistencia a la deformación y por su reducido peso. Para una respuesta especialmente rápida y suave de los frenos.

Una nueva generación de mordazas de freno en el eje delantero (en combinación con pastillas de freno sobredimensionadas y un servofreno de desarrollo completamente nuevo) proporciona un mejorado efecto de freno y una excelente resistencia a la deformación. Incluso en condiciones de uso continuado. El sistema de refrigeración de los frenos de nuevo desarrollo, con los spoiler de aire de refrigeración modificados en los ejes delantero y trasero, optimiza adicionalmente las prestaciones de freno y aumenta considerablemente la resistencia a la deformación.

Al incrementado impulso de progresión del Boxster y del Boxster S contribuyen también los discos de freno autoventilados: su diámetro ha sido aumentado 15 mm en el eje delantero del Boxster S, que pasa a un total de 330 mm. Detrás su diámetro es de 299 mm, igual que en el Boxster. Para una mejor respuesta sobre mojado, los discos de freno están perforados. Las mordazas de freno del Boxster son negras, las del Boxster S se han mantenido en rojo.