Ambos os modelos Boxster já se encontram preparados para a utilização de combustível com um teor máximo de 10% de etanol. O uso de etanol traduz-se numa melhoria do equilíbrio de CO2, uma vez que o biocombustível é produzido à base de plantas que absorvem CO2 da atmosfera para o seu crescimento. No sistema de combustível, minimizámos as emissões de hidrocarbonetos. Também o filtro de carbono activo e o revestimento multi-camadas do depósito de combustível contribuem para essa redução. Todos os tubos de combustível são fabricados em plástico multi-camadas, aço ou alumínio.