De nieuwe Boxster modellen zijn voorbereid op het gebruik van een benzinemengsel met maximaal 10% ethanol. Dat levert alvast een aanzienlijke bijdrage aan de CO2-huishouding. Biologische brandstoffen als ethanol worden ondermeer verkregen uit resten van planten, die tijdens de groei CO2 aan de atmosfeer onttrekken.

De uitstoot van koolwaterstof door het brandstofsysteem werd tot een minimum beperkt door de toepassing van een absorptie-koolfilter en een speciale coating van de benzinetank. Alle brandstofleidingen zijn gemaakt van aluminium, terwijl de leidingen die benzinedampen afvoeren uit meerlaags kunststof vervaardigd zijn.